Projektek

Comprehensive interrogation of genetic interactions in cancer

Megvalósítás alatt lévő/Futó projekt

Összefoglaló:

A rák kifejlődésért a kezdetben egészséges szomatikus sejtekben végbemenő mutációk a felelősek. A specifikusan rákot okozó mutációk hatásának mélyebb megértéséhez kontrollált kísérletekre van szükség, ahol akár laboratóriumi sejtvonalakban, akár állati (pl. egér) kísérleti modellekben létrehoznak egy mutációt, majd megmérik a tumor növekedésre kifejtett hatását. Ugyanakkor az emberi rákos tumorokban szinte kivétel nélkül egyszerre több mutáció okozza a rákos növekedést. Ez amiatt okoz nehézséget, mert ezen mutációk hatásai egymással kölcsönhatásban vannak, azaz az egyenként megmért mutációs hatások ismeretében lehetetlen jól megjósolni egy dupla-mutáns viselkedését. Komplexebb genotípusok (pl. kétszeres, vagy háromszoros mutáns) létrehozása állati modellekben korántsem egyszerű feladat, és ez nagyban korlátozza annak megértését, hogy több mutáció együttesen hogyan változtat egy sejtet rákossá.

Kutatómunkánk során egy olyan módszertant fejlesztünk, amivel lentivírusok sejtekbe való bejuttatásával, és a CRISPR-Cas9 genommérnöki technika használatával akár több száz különböző komplex genotípust tudunk létrehozni majd az ezekből fejlődő tumoroknak a méretét meg tudjuk határozni DNS vonalkódok szekvenálásával. Ezáltal kivételes minőségű és mennyiségű adatot kapunk. Eredményeink segítenek majd kivételesen agresszív rákgenotípusok azonosításában és a rákos tumorokban tapasztalt genetika interakciók általános mintázatainak feltérképezésében.

Résztvevő kutatók:

• Boross Gábor Zoltán
• Székely Tamás
• Szamecz Márton