Kutatási infrastruktúra

Összefoglalás

A HUN-REN ÖK ETI csillebérci telephelyén 2024-ben indult el és ma már teljes kapacitással működik egy járványökológiai és tumor evolúciós laboratórium, amely alkalmas mind a terepen gyűjtött, mind a laboratóriumban létrehozott biológiai minták molekuláris biológiai feldolgozására. Ez ma már elengedhetetlen feltétele a modern kutatásoknak egy evolúciós és ökológiai kutatóintézetben, hiszen ezekben a kutatásokban általában szükség van a különböző fajok részletes genetikai vizsgálatára, a populációk genetikai diverzitásának feltárása, vagy akár az egyedek közötti genetikai kapcsolatok pontos azonosítására. Az ETI laboratóriumának egyik fő profilja a kullancsok által terjesztett kórokozók kimutatása és azonosítása, magukból a vektorokból. Viszont, ahhoz hogy pontos képet kapjunk ezen kórokozók járványökológia jellegzetességeiről, vizsgáljuk még a kullancsok gazdaszervezeteit is, ezért a laboratóriumban feldolgozásra kerülnek házi és vadonélő állatok szövet- és vérmintái is, amelyekből szintén a kórokozók kimutatása és elemzése az elsődleges célunk. A munkafolyamatok négy különálló helyiségben zajlanak le. Az előkészítő munka, amely a gyakorlatban a különböző állat- és szövetminták preparálását, valamint az azokból történő DNS izolálását jelenti, egy Class II Biosafety fülkével felszerelt helységben folyik, elkerülendő a kórokozókkal való potenciális fertőződés esélyét. A második, Pre-PCR helyiségben folyik a DNS minták tisztítása, feldolgozása, mennyiségi mérésére stb., majd a kész minták a harmadik helységben kerülnek bele a PCR készülékekbe, ahol megtörténik a nukleinsavak enzimatikus felszaporítása, hogy a kórokozókat tartalmazó mintákban kimutatható mennyiségre dúsuljon a DNS-ük mennyisége. Ezután a kész minták a Post-PCR helyiségbe kerülve méret szerinti elválasztáson (gélelektroforézis) esnek át, majd UV-fénnyel történő megvilágítással vizualizáljuk azokat.

A labor kettős funkciót tölt be: itt folynak még a rákbetegség evolúciós vonatkozásait vizsgáló kutatások. A DNS laboratóriumban a molekuláris klónozás különféle módszereit alkalmazzák és fejlesztik kutatóink, hogy végül a CRISPR genommérnöki és a DNS-vonalkód technológiák ötvözésével a különböző rákot okozó mutációk progressziós (evolúciós zsargonban adaptációs) tájképeit tudjuk feltérképezni a korábbinál jóval nagyobb részletességgel. Egy emlős sejttenyésztésre alkalmas labor pedig most épül ki, amelyben humán és egér rákos sejtvonalakat leszünk képesek kettő és három dimenzióban növeszteni, ezáltal házon belül mérni a különböző rosszindulatú genotípusok terjedési sebességét kísérleti tumor modellekben.